化合物により極性が異なるからです
薄層板の表面にはシリカゲルがコーティングされています。シリカゲルにはOH基がたくさんついているので極性はものすごく高いです。極性が高いもの同士はよく相互作用するので、極性が高いものほどシリカゲルに強く吸着します。逆に極性が低いとあまり相互作用はないので素通りすりだけです
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